Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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