Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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