Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prpf8Q99PV0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms