Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms