Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RetnQ99P87 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms