Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms