Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gins4Q99LZ3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms