Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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