Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms