Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stx18Q8VDS8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms