Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lin28aQ8K3Y3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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