Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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SbsnQ8CIT9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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SbsnQ8CIT9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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SbsnQ8CIT9 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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