Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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