Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc43a2Q8CGA3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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