Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Nhlrc3Q8CCH2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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