Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cwc22Q8C5N3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms