Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ube2q1Q7TSS2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms