Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Dsg1cQ7TSF0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Dsg1cQ7TSF0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Dsg1cQ7TSF0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Dsg1cQ7TSF0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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