Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms