Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms