Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms