Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LpoQ5SW46 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LpoQ5SW46 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms