Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms