Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BB287469Q3UT53 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms