Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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