Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms