Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc10Q3TLI0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms