Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms