Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms