Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cnn1Q08091 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cnn1Q08091 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cnn1Q08091 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cnn1Q08091 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cnn1Q08091 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cnn1Q08091 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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