Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox12Q04890 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms