Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl7Q03366 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms