Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs2Q03350 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms