Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms