Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms