Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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