Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms