Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms