Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp46P62069 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp46P62069 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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