Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms