Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lbx1P52955 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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