Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms