Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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