Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ItgavP43406 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ItgavP43406 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ItgavP43406 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms