Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtlP38585 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TtlP38585 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtlP38585 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtlP38585 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtlP38585 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtlP38585 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtlP38585 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtlP38585 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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