Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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