Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PparaP23204 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PparaP23204 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms