Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18524 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18524 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18524 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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