Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms