Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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